วาลแกนซิโคลเวียร์ใช้หลักในการป้องกันและรักษาการติดเชื้อไวรัสไซโตเมกาโลไวรัส (CMV) โดยเฉพาะในผู้ป่วยที่มีภูมิคุ้มกันบกพร่อง เช่น ผู้ที่ได้รับการปลูกถ่ายอวัยวะหรือผู้ป่วย HIV/AIDS มีประสิทธิภาพในการลดความเสี่ยงของโรค CMV ในผู้รับการปลูกถ่ายไต หัวใจ และไต-ตับอ่อน นอกจากนี้ ยังใช้รักษา CMV retinitis ในผู้ป่วยเอดส์ เพื่อช่วยป้องกันตาบอด วาลแกนซิโคลเวียร์ยังใช้ในการจัดการการติดเชื้อ CMV แต่กำเนิดในทารกแรกเกิด เพื่อลดความรุนแรงของภาวะแทรกซ้อนที่เกี่ยวข้อง การดูดซึมทางปากทำให้เป็นทางเลือกที่สะดวกแทนการให้ทางหลอดเลือดดำ ปรับปรุงการปฏิบัติตามของผู้ป่วยและคุณภาพชีวิต วาลแกนซิโคลเวียร์ช่วยยับยั้งการแพร่พันธุ์ของไวรัส โดยการแปลงเป็นสารออกฤทธิ์ในร่างกายที่สามารถขัดขวางการสร้าง DNA ของไวรัสได้อย่างมีประสิทธิภาพ