ฟาวิพิราเวียร์ถูกใช้หลัก ๆ เป็นยาต้านไวรัส โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีประสิทธิภาพต่อไวรัส RNA ได้รับความสนใจอย่างมากสำหรับการนำมาใช้รักษาไข้หวัดใหญ่ โดยเฉพาะในกรณีที่ยาต้านไวรัสอื่นไม่เห็นผล ในช่วงการระบาดของโควิด-19 ถูกสำรวจเป็นการรักษาที่มีศักยภาพสำหรับการติดเชื้อ SARS-CoV-2 โดยบางประเทศอนุมัติให้ใช้ในกรณีฉุกเฉินเพื่อลดปริมาณไวรัสและบรรเทาอาการ นอกจากนี้ยังแสดงศักยภาพในการต่อสู้กับการติดเชื้อไวรัสอื่น ๆ เช่น อีโบลา ไข้ลัสซา และไข้เหลือง กลไกการออกฤทธิ์คือการยับยั้ง viral RNA-dependent RNA polymerase จึงป้องกันการสืบพันธุ์ของไวรัส ฟาวิพิราเวียร์มักให้ทางปาก ทำให้สะดวกสำหรับการรักษานอกโรงพยาบาล อย่างไรก็ตาม การใช้มักสงวนไว้สำหรับกรณีรุนแรงหรือดื้อยา เนื่องจากผลข้างเคียงที่เป็นไปได้และความจำเป็นในการวิจัยทางคลินิกเพิ่มเติมเพื่อยืนยันประสิทธิภาพและความปลอดภัย