โอมาซิโคลเวียร์ใช้หลักในการรักษาโรคติดเชื้อไวรัสตระกูลเฮอร์ปีส โดยเฉพาะ เป็นยาต้านไวรัสที่มีประสิทธิภาพต่อภาวะต่าง ๆ เช่น การติดเชื้อไวรัสเฮอร์ปีสซิมเพล็กซ์ (HSV) รวมถึงเริมที่อวัยวะเพศและแผลร้อนที่ปาก รวมถึงเฮอร์ปีสซอสเตอร์ (งูสวัด) สารนี้ทำงานโดยยับยั้งการสังเคราะห์ DNA ของไวรัส ทำให้ลดความรุนแรงและระยะเวลาของการกำเริบ นอกจากนี้ยังกำลังศึกษาความเป็นไปได้ในการรักษาการติดเชื้อไวรัสอื่น ๆ รวมถึงไซโตเมกาโลไวรัส (CMV) ในผู้ป่วยที่มีระบบภูมิคุ้มกันบกพร่อง โอมาซิโคลเวียร์มักให้ทางปาก ซึ่งเป็นทางเลือกการรักษาที่สะดวกสำหรับผู้ป่วย ความสามารถในการจัดการอาการและป้องกันการเกิดซ้ำทำให้เป็นยาที่มีคุณค่าในกระบวนการบำบัดต้านไวรัส