อะพริซิทาบีนถูกใช้เป็นยาต้านไวรัสสำหรับการรักษาโรคเอดส์ (HIV) โดยออกฤทธิ์ยับยั้งการทำงานของเอนไซม์รีเวิร์สทรานสคริปเตส (reverse transcriptase) ซึ่งเป็นขั้นตอนสำคัญในการเพิ่มจำนวนของไวรัส HIV ยานี้ช่วยลดปริมาณไวรัสในร่างกายและเสริมสร้างระบบภูมิคุ้มกันของผู้ป่วย มักใช้ร่วมกับยาต้านไวรัสอื่นๆ ในรูปแบบของการรักษาแบบรวม (combination therapy) เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและลดโอกาสการดื้อยา นอกจากนี้ ยังมีการศึกษาถึงศักยภาพในการใช้รักษาการติดเชื้อไวรัสอื่นๆ ที่เกี่ยวข้อง