สารละลายไอโอดีนถูกใช้อย่างแพร่หลายในด้านต่าง ๆ โดยเฉพาะในทางการแพทย์เพื่อการทำความสะอาดและฆ่าเชื้อแผล ช่วยป้องกันการติดเชื้อแบคทีเรีย เชื้อรา และไวรัสก่อนและหลังการทำแผลหรือผ่าตัด นอกจากนี้ยังใช้เป็นสารฆ่าเชื้อพื้นผิวอุปกรณ์ทางการแพทย์และในห้องปฏิบัติการ ในอุตสาหกรรม สารละลายไอโอดีนใช้ในการตรวจสอบคุณภาพน้ำและการควบคุมจุลินทรีย์ในกระบวนการผลิตอาหารและเครื่องดื่ม ในภาคเกษตรกรรม ใช้ล้างเมล็ดพันธุ์หรืออุปกรณ์เพื่อลดความเสี่ยงจากโรคพืชที่เกิดจากจุลินทรีย์ สารละลายไอโอดีนยังมีบทบาทในห้องปฏิบัติการวิเคราะห์ เช่น การทดสอบแป้งในตัวอย่างชีวภาพ ซึ่งจะให้สีน้ำเงินเข้มเมื่อเจอกับแป้ง อย่างไรก็ตาม การใช้สารนี้ต้องระมัดระวัง เพราะอาจก่อให้เกิดการระคายเคืองหรือแพ้ในบางคน โดยเฉพาะหากใช้ในขนาดเข้มข้นหรือติดต่อกันเป็นเวลานาน