กรดไตรคลอโรไอโซไซยานูริกถูกใช้อย่างแพร่หลายเป็นสารฆ่าเชื้อและน้ำยาฆ่าเชื้อในกระบวนการบำบัดน้ำ โดยเฉพาะอย่างยิ่งสำหรับสระว่ายน้ำและน้ำดื่ม เนื่องจากความสามารถในการปล่อยคลอรีนอย่างมีประสิทธิภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในการทำความสะอาดอุปกรณ์อุตสาหกรรม พื้นผิว และสภาพแวดล้อมเพื่อควบคุมการเจริญเติบโตของจุลินทรีย์ ในเกษตรกรรม มันทำหน้าที่เป็นสารฟอกขาวและสารฆ่าเชื้อสำหรับพืชผลและพื้นที่เลี้ยงสัตว์ นอกจากนี้ ยังถูกนำไปใช้ในอุตสาหกรรมสิ่งทอสำหรับการฟอกผ้าและในอุตสาหกรรมกระดาษสำหรับการฟอกเยื่อกระดาษ คุณสมบัติการออกซิเดชันที่แข็งแกร่งทำให้มีประสิทธิภาพในการควบคุมกลิ่นและการบำบัดของเสีย