ไพโรนาริดีนถูกใช้เป็นยาต้านมาลาเรียเป็นหลัก มีประสิทธิภาพต่อเชื้อ Plasmodium ทุกชนิด รวมถึงเชื้อที่ดื้อต่อยาอื่นๆ เช่น คลอโรควิน มักใช้ร่วมกับอาร์ทีซูเนทในยารักษามาลาเรียแบบผสมฐานอาร์ทีมิซินิน (ACTs) เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและลดความเสี่ยงต่อการดื้อยา สูตรผสมนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการรักษามาลาเรียไม่รุนแรงทั้งในผู้ใหญ่และเด็ก นอกจากนี้ ไพโรนาริดีนยังแสดงศักยภาพในการรักษาการติดเชื้อปรสิตอื่นๆ แม้ว่าการใช้ในด้านนี้ยังคงอยู่ในการวิจัย กิจกรรมครอบคลุมกว้างและความเป็นพิษต่ำทำให้เป็นส่วนประกอบสำคัญในความพยายามระดับโลกในการต่อสู้กับมาลาเรีย โดยเฉพาะในพื้นที่ที่มีอัตราการแพร่กระจายสูง