ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยาต่างๆ โดยเฉพาะในการผลิตยาที่มีโครงสร้างอิมิดาโซลซึ่งมีคุณสมบัติต้านเชื้อรา ต้านฮิสตามีน และต้านมะเร็ง มีบทบาทสำคัญในการพัฒนายับยั้งตัวรับฮิสตามีน H2 และโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ เนื่องจากสามารถทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับระบบเฮเตอโรไซคลิกที่ซับซ้อนมากขึ้น รูปแบบเกลือไฮโดรคลอไรด์ช่วยเพิ่มความละลายและความเสถียร ทำให้เหมาะสำหรับใช้ในสภาพแวดล้อมปฏิกิริยาน้ำ นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยเคมียารักษาเพื่อศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรม (SAR) ที่เกี่ยวข้องกับอนุพันธ์อิมิดาโซล