อีพินาสทีนใช้หลักในการรักษาเยื่อบุตาอักเสบจากภูมิแพ้ (allergic conjunctivitis) โดยช่วยบรรเทาอาการ เช่น ความแดง คัน และบวมของดวงตา มันทำหน้าที่เป็นยาแก้แพ้ (antihistamine) และยาคงเสถียรเซลล์ mast cell ซึ่งช่วยลดการหลั่งฮิสตามีนและสารอักเสบอื่นๆ ที่ก่อให้เกิดปฏิกิริยาแพ้ได้อย่างมีประสิทธิภาพ

ในด้านจักษุวิทยา อีพินาสทีนมีในรูปแบบน้ำตาเทียม (eye drops) ทำให้สะดวกในการทาที่บริเวณที่ได้รับผลกระทบโดยตรง มันมีคุณค่าจากกลไกการออกฤทธิ์แบบคู่ ซึ่งไม่เพียงบรรเทาอาการที่มีอยู่ แต่ยังช่วยป้องกันการเกิดซ้ำ

นอกจากนี้ อีพินาสทีนมีจุดเริ่มออกฤทธิ์เร็วและฤทธิ์ยาวนาน มักใช้เพียงวันละสองครั้ง โปรไฟล์ความปลอดภัยและผลข้างเคียงน้อยทำให้เป็นตัวเลือกที่เหมาะสมสำหรับผู้ใหญ่และเด็กที่เป็นโรคภูมิแพ้ตา

นอกเหนือจากการใช้หลัก อีพินาสทีนยังถูกสำรวจสำหรับการประยุกต์ใช้ในภาวะแพ้อื่นๆ แม้ว่าการใช้จะยังคงมุ่งเน้นไปที่ภูมิแพ้ทางตาหลัก