()-Ketoconazole ใช้เป็นยาต้านเชื้อราที่มีประสิทธิภาพสูง หลักๆแล้วใช้ในการรักษาโรคติดเชื้อราที่ผิวหนัง เล็บ และเส้นผม เช่น โรคเกลื้อน โรคเชื้อราที่เท้า (ฮ่องกงฟุต) และโรคเชื้อราที่หนังศีรษะ นอกจากนี้ยังใช้ในการรักษาโรคติดเชื้อยีสต์ในช่องปากและช่องคลอดได้อีกด้วย ในบางกรณีอาจใช้เพื่อควบคุมการเจริญเติบโตของเชื้อราที่ทำให้เกิดโรคในผู้ที่มีระบบภูมิคุ้มกันอ่อนแอ เช่น ผู้ป่วยโรคเอดส์หรือผู้ที่ได้รับเคมีบำบัด ()-Ketoconazole สามารถใช้ในรูปแบบครีม แชมพู หรือยาชนิดรับประทาน ขึ้นอยู่กับชนิดและความรุนแรงของอาการติดเชื้อ