เทอร์บินาฟีนเป็นยาต้านเชื้อราที่ใช้กันอย่างแพร่หลาย โดยเฉพาะในการรักษาการติดเชื้อราที่ผิวหนัง ผม และเล็บ มีประสิทธิภาพสูงต่อเชื้อเดอร์มาโตไฟต์ ซึ่งเป็นสาเหตุของโรค เช่น เชื้อราที่เท้า กลากขาหนีบ และกลาก เนื่องจากมีฤทธิ์ฆ่าเชื้อรา จึงไม่เพียงยับยั้งการเจริญเติบโตของเชื้อรา แต่ยังกำจัดเชื้อโรค ทำให้อัตราการกลับเป็นซ้ำต่ำ

การประยุกต์ใช้หลักคือการรักษาแบบรับประทานและทาผิวสำหรับโรคเล็บอักเสบจากเชื้อรา (onychomycosis) ซึ่งเป็นการติดเชื้อราที่เล็บที่รักษายาก ยารับประทานเทอร์บินาฟีนถือเป็นการรักษาระดับแรกเนื่องจากมีอัตราการหายสูงและสามารถซึมทะลุเข้าไปในเนื้อเล็บได้ดี สูตรทาผิว เช่น ครีมและสเปรย์ ใช้สำหรับการติดเชื้อที่ผิวหนังตื้น ให้การรักษาแบบเฉพาะที่โดยมีการดูดซึมเข้าสู่กระแสเลือดน้อย

กลไกการออกฤทธิ์ที่เลือกสรร—ยับยั้งการสังเคราะห์เออร์กอสเตอรอล ซึ่งเป็นส่วนประกอบสำคัญของเยื่อหุ้มเซลล์เชื้อรา—ทำให้มีพิษต่อเซลล์มนุษย์น้อย ส่งผลให้มีโปรไฟล์ความปลอดภัยที่ดี เทอร์บินาฟีนยังใช้ในยาสัตว์เพื่อรักษาการติดเชื้อราในสัตว์