ใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการผลิตยารักษาโรคเบาหวานและยาต้านไวรัส ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ เนื่องจากมีกลุ่มกวานิดีนที่ทำปฏิกิริยาได้ ซึ่งสามารถเข้าร่วมในการสร้างสารประกอบเฮเตอร์โรไซคลิก นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนาสารเกษตร เช่น สมุนไพรกำจัดวัชพืชบางชนิดและสารควบคุมการเจริญเติบโตของพืช รูปแบบเกลือไฮโดรคลอไรด์ช่วยเพิ่มความละลายและความเสถียร ทำให้เหมาะสำหรับใช้ในระบบปฏิกิริยาน้ำ นอกจากนี้ ยังมีการสำรวจในงานวิจัยสำหรับบทบาทที่เป็นไปได้ในการยับยั้งเอนไซม์และเป็นตัวเร่งปฏิกิริยาในปฏิกิริยาการควบแน่นเฉพาะเจาะจง