ฟลินโดคาลเนอร์ ใช้ในอุตสาหกรรมยาเป็นส่วนประกอบสำคัญในการพัฒนายาที่เกี่ยวข้องกับระบบประสาท โดยเฉพาะในกลุ่มยาที่มีผลต่อการควบคุมการส่งสัญญาณของเซลล์ประสาท ช่วยในการปรับสมดุลของสารสื่อประสาทในสมอง ทำให้มีศักยภาพในการใช้รักษาภาวะทางจิตเวช เช่น ความวิตกกังวล ภาวะซึมเศร้า และโรควิตกกังวลรุนแรง รวมถึงมีการวิจัยเพื่อใช้ในผู้ป่วยที่มีอาการชักหรือโรคลมชักบางประเภท เนื่องจากมีฤทธิ์ในการยับยั้งการกระตุ้นของเซลล์ประสาทเกินปกติ นอกจากนี้ยังถูกพิจารณาในการพัฒนายาใหม่ที่ต้องการความเฉพาะเจาะจงสูงต่อตัวรับในสมอง โดยไม่ก่อให้เกิดผลข้างเคียงมากจากกลไกอื่นๆ