อินดิรูบิน-3′-ออกไซม์ถูกนำมาใช้ในการวิจัยทางการแพทย์เพื่อศึกษาคุณสมบัติในการต้านมะเร็ง โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการยับยั้งการเจริญเติบโตของเซลล์มะเร็งหลายชนิด เช่น มะเร็งเม็ดเลือดขาว มะเร็งลำไส้ใหญ่ และมะเร็งเต้านม นอกจากนี้ยังมีการศึกษาถึงศักยภาพในการต้านการอักเสบและการปรับปรุงระบบภูมิคุ้มกัน ซึ่งอาจเป็นประโยชน์ในการรักษาโรคเรื้อรังต่าง ๆ ปัจจุบันยังอยู่ในขั้นตอนการวิจัยและทดลองทางคลินิกเพื่อหาประสิทธิภาพและความปลอดภัยก่อนนำมาใช้ในมนุษย์