ซัลฟาลีนถูกใช้หลักly เป็นยาต้านแบคทีเรีย โดยเฉพาะในการรักษาโรคมาลาเรีย ซัลฟาลีนอยู่ในกลุ่มยาซัลโฟนาไมด์ และทำงานโดยยับยั้งการเจริญเติบโตและการสืบพันธุ์ของปรสิตมาลาเรีย มักใช้ร่วมกับยาต้านมาลาเรียอื่นๆ เช่น ไพริเมทามีน เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและลดความเสี่ยงต่อการดื้อยา ซัลฟาลีนมีประโยชน์โดยเฉพาะในพื้นที่ที่โรคมาลาเรียระบาด ทำให้เป็นตัวเลือกการรักษาที่คุ้มค่าและเข้าถึงได้ นอกจากนี้ ยังมีการใช้ซัลฟาลีนในการจัดการการติดเชื้อแบคทีเรียบางชนิด แม้ว่าการใช้ในบริบทนี้จะน้อยกว่าการประยุกต์ใช้ต้านมาลาเรีย