กรามิซิดิน เอ ใช้หลักๆ เป็นยาปฏิชีวนะในการรักษาการติดเชื้อแบคทีเรีย โดยเฉพาะที่เกิดจากแบคทีเรียแกรมบวก มีประสิทธิภาพในการรบกวนเยื่อหุ้มเซลล์แบคทีเรีย ทำให้เกิดการตายของเซลล์ ซึ่งทำให้มีคุณค่าในการนำมาใช้แบบทาเฉพาะที่ เช่น ในรูปแบบของครีมและยาทา สำหรับรักษาการติดเชื้อที่ผิวหนังและแผล นอกจากนี้ ยังใช้ในงานวิจัยเพื่อศึกษาการขนส่งไอออนข้ามเยื่อหุ้มเซลล์ เนื่องจากความสามารถในการสร้างช่องทางที่อนุญาตให้ไอออนบวกหนึ่งค่า (monovalent cations) ผ่านไปได้ เมื่อใช้ร่วมกับยาปฏิชีวนะอื่นๆ จะช่วยเพิ่มประสิทธิภาพต่อสายพันธุ์แบคทีเรียที่ดื้อยา บทบาทในการศึกษายื่อหุ้มเซลล์ยังช่วยให้เข้าใจกระบวนการในเซลล์และพัฒนากลยุทธ์การรักษาใหม่