บาลอฟลอกซาซิน ไดไฮเดรตใช้เป็นยาปฏิชีวนะในกลุ่มฟลูออโรควิโนโลน ซึ่งออกฤทธิ์ต่อต้านเชื้อแบคทีเรียแกรมบวกและแกรมลบได้กว้างขวาง มักใช้รักษาการติดเชื้อในระบบทางเดินหายใจ เช่น โรคปอดบวม โรคหลอดลมอักเสบ รวมถึงการติดเชื้อในระบบทางเดินปัสสาวะ เช่น กระเพาะปัสสาวะอักเสบ และกรวยไตอักเสบ นอกจากนี้ยังสามารถใช้รักษาการติดเชื้อที่ผิวหนังและเนื้อเยื่ออ่อนได้อีกด้วย ยานี้มีประสิทธิภาพสูงในการยับยั้งการเจริญเติบโตของเชื้อแบคทีเรียโดยการรบกวนกระบวนการสังเคราะห์ DNA ของเชื้อแบคทีเรีย นอกจากนี้ ยังใช้ในกรณีที่ผู้ป่วยดื้อยาในกลุ่มฟลูออโรควิโนโลนอื่นๆ เพื่อเป็นทางเลือกในการรักษา และมีการศึกษาการนำไปใช้ในสัตวแพทย์ในการรักษาการติดเชื้อแบคทีเรียในสัตว์ด้วย คุณสมบัติด้านประสิทธิภาพและความปลอดภัยทำให้เป็นตัวเลือกที่น่าเชื่อถือในการจัดการโรคติดเชื้อแบคทีเรียในสถานพยาบาล