โอมาดาไซคลินใช้ในการรักษาการติดเชื้อแบคทีเรียที่หลากหลาย โดยเฉพาะการติดเชื้อที่ผิวหนังและโครงสร้างผิวหนัง รวมถึงภาวะปอดบวมที่ได้จากชุมชน ยาปฏิชีวนะชนิดนี้มีประสิทธิภาพในการต่อต้านแบคทีเรียแกรมบวกและแกรมลบ รวมถึงแบคทีเรียที่ดื้อต่อยาอื่นๆ ทำให้เป็นทางเลือกในการรักษาที่สำคัญสำหรับผู้ป่วยที่มีการติดเชื้อที่รักษายากหรือดื้อยา นอกจากนี้ ยังใช้ในกรณีที่ผู้ป่วยไม่สามารถใช้ยาปฏิชีวนะกลุ่มอื่นได้เนื่องจากอาการแพ้หรือข้อจำกัดอื่นๆ