เมทิซิลลินโซเดียมซอลต์ ใช้หลักในการรักษาการติดเชื้อแบคทีเรีย โดยเฉพาะที่เกิดจากสแตฟิโลค็อกคัสที่ผลิตเพนิซิลลิเนส ซึ่งดื้อต่อเพนิซิลลินอื่นๆ เนื่องจากสามารถต้านทานการย่อยสลายโดยเอนไซม์ของแบคทีเรีย ทำให้มีประสิทธิภาพต่อเชื้อที่ดื้อต่อเพนิซิลลินอื่น ช่วยต่อสู้กับการติดเชื้อ เช่น การติดเชื้อที่ผิวหนังและเนื้อเยื่ออ่อน การติดเชื้อทางเดินหายใจ และภาวะติดเชื้อในกระแสเลือด โดยปกติให้ทางฉีดเพื่อให้เข้าสู่กระแสเลือดอย่างรวดเร็วและมีประสิทธิภาพ อย่างไรก็ตาม การใช้ลดลงเนื่องจากการเกิดของ Staphylococcus aureus ที่ดื้อต่อเมทิซิลลิน (MRSA) ซึ่งนำไปสู่การพัฒนายาปฏิชีวนะทางเลือก แม้เช่นนั้น ยังคงเป็นเครื่องมืออ้างอิงทางประวัติศาสตร์และคลินิกที่สำคัญในการศึกษาความดื้อของยาปฏิชีวนะและการติดเชื้อแบคทีเรีย