ซินนามายซิน (Cinnamycin) ใช้หลักในการต้านจุลชีพ โดยเฉพาะต่อแบคทีเรียแกรมบวก มีฤทธิ์รุนแรง โดยทำงานโดยจับกับฟอสฟาติดิลเอททานอลามีนในเยื่อหุ้มเซลล์แบคทีเรีย ทำให้ความสมบูรณ์ของเยื่อหุ้มเซลล์เสียหายและนำไปสู่การตายของเซลล์ สิ่งนี้ทำให้มีประสิทธิภาพในการควบคุมจุลินทรีย์ที่ทำให้อาหารเสีย โดยเฉพาะในผลิตภัณฑ์นมและเนื้อสัตว์

นอกจากการใช้ต้านจุลชีพแล้ว ซินนามายซินยังแสดงศักยภาพในงานทางการแพทย์เนื่องจากมีฤทธิ์ต้านไวรัสและต้านมะเร็ง ได้รับการศึกษาในความสามารถในการยับยั้งการสืบพันธุ์ของไวรัสหุ้มเยื่อบางชนิดโดยการโต้ตอบกับลิปิดในเยื่อหุ้มเซลล์ การวิจัยยังสำรวจบทบาทในการกำหนดเป้าหมายเซลล์มะเร็ง โดยกระตุ้นการตายของเซลล์แบบอะพอพโทซิสผ่านการทำลายเยื่อหุ้มเซลล์และการปรับเปลี่ยนเส้นทางสัญญาณ

ความจำเพาะของซินนามายซินต่อฟอสโฟลิปิดบางชนิดทำให้เป็นเครื่องมือที่มีประโยชน์ในการวิจัยทางชีวเคมี โดยเฉพาะในการศึกษาความโครงสร้างของเยื่อหุ้มเซลล์และการโต้ตอบระหว่างลิปิด-โปรตีน ศักยภาพในการพัฒนายาใหม่และเป็นสารกันเสียจากธรรมชาติยังคงเป็นที่สนใจในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและอาหาร นอกจากนี้ยังถูกศึกษาเป็นโมเดลในการเข้าใจกลไกการออกฤทธิ์ของเปปไทด์ต้านจุลชีพชนิดแลคติน (lantibiotics) และมีศักยภาพในการพัฒนาเป็นสารออกฤทธิ์ใหม่สำหรับรักษาการติดเชื้อที่ดื้อยา