ทรวาฟลอกซาซินถูกใช้เป็นยาปฏิชีวนะในกลุ่มฟลูออโรควิโนโลน ซึ่งมีประสิทธิภาพในการรักษาการติดเชื้อแบคทีเรียที่รุนแรงและซับซ้อน มักใช้ในกรณีที่การติดเชื้อไม่ตอบสนองต่อยาปฏิชีวนะชนิดอื่น หรือเมื่อผู้ป่วยมีภาวะติดเชื้อที่คุกคามชีวิต เช่น ปอดบวมที่ได้จากชุมชนหรือในโรงพยาบาล การติดเชื้อในช่องท้อง และการติดเชื้อในทางเดินปัสสาวะที่ซับซ้อน อย่างไรก็ดี เนื่องจากมีรายงานผลข้างเคียงที่รุนแรง เช่น ความเสียหายต่อตับ การใช้ยานี้จึงถูกจำกัดเฉพาะในสถานการณ์ที่จำเป็นจริงๆ และต้องอยู่ภายใต้การดูแลของแพทย์อย่างใกล้ชิด