ซัลฟาเมทอกซาโซล โซเดียมใช้เป็นยาปฏิชีวนะในกลุ่มซัลโฟนาไมด์ โดยมีคุณสมบัติในการยับยั้งการเจริญเติบโตของแบคทีเรีย มักใช้ในการรักษาโรคติดเชื้อต่าง ๆ เช่น โรคติดเชื้อในระบบทางเดินปัสสาวะ โรคติดเชื้อในระบบทางเดินหายใจ และโรคติดเชื้อในระบบทางเดินอาหาร นอกจากนี้ยังใช้ร่วมกับไตรเมโทพริม (Trimethoprim) ในรูปแบบยาสูตรผสม เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพในการรักษาและลดการดื้อยาของแบคทีเรีย ยานี้มีบทบาทสำคัญในการรักษาโรคติดเชื้อที่เกิดจากแบคทีเรียที่อ่อนไหวต่อยา