Phthalylsulfacetamide ใช้หลักเป็นยาต้านแบคทีเรีย โดยเฉพาะในการรักษาการติดเชื้อในลำไส้ มีประสิทธิภาพต่อแบคทีเรียแกรมบวกและแกรมลบ ทำให้เหมาะสำหรับจัดการโรคเช่นอหิวาตกโรคจากแบคทีเรียและโรคกระเพาะอาหารอักเสบจากแบคทีเรีย สารนี้ทำงานโดยยับยั้งการสังเคราะห์กรดโฟลิกในแบคทีเรีย ซึ่งจำเป็นสำหรับการเจริญเติบโตและการสืบพันธุ์ มักให้ทางปาก เนื่องจากดูดซึมจากทางเดินอาหารได้น้อย ทำให้ออกฤทธิ์โดยตรงต่อเชื้อโรคในลำไส้ นอกจากนี้ยังใช้ในสัตวแพทย์เพื่อรักษาการติดเชื้อที่คล้ายกันในสัตว์ การออกฤทธิ์เฉพาะที่ในลำไส้ช่วยลดผลข้างเคียงระบบ ทำให้เป็นตัวเลือกที่เหมาะสมสำหรับการติดเชื้อแบคทีเรียเฉพาะที่ในระบบทางเดินอาหาร