Isoboonein acetate ใช้หลักในงานวิจัยเนื่องจากมีศักยภาพทางชีวภาพ สารนี้ได้รับความสนใจในงานศึกษาทางเภสัชวิทยาเนื่องจากโครงสร้างที่อาจมีผลต่อเส้นทางในเซลล์ สารนี้ถูกตรวจสอบเพื่อผลต่อการต้านการอักเสบและต้านอนุมูลอิสระ ทำให้เป็นผู้สมัครสำหรับการพัฒนายาในระยะเริ่มต้น นอกจากนี้ยังใช้ในเคมีวิเคราะห์เป็นมาตรฐานอ้างอิงสำหรับการระบุผลิตภัณฑ์จากธรรมชาติที่เกี่ยวข้อง เนื่องจากโปรไฟล์ความเสถียรและปฏิกิริยา จึงใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์อนุพันธ์ที่มีชีวกิจกรรมสูงขึ้น การประยุกต์ใช้ยังจำกัดอยู่ที่การศึกษาในห้องปฏิบัติการและการทดลอง โดยไม่มีรายงานการใช้ในอุตสาหกรรมหรือเชิงพาณิชย์ในปัจจุบัน