3-Methyl-4-(trifluoromethoxy)aniline ใช้หลักๆ เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตรและเภสัชกรรม มีบทบาทสำคัญในการผลิตสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง โดยช่วยเพิ่มประสิทธิภาพด้วยการเป็นส่วนหนึ่งของโครงสร้างสารออกฤทธิ์หลัก ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม ใช้ในการพัฒนาสารประกอบที่มีคุณสมบัติบำบัดที่เป็นไปได้ โดยเฉพาะในการสร้างโมเลกุลที่เล็งเป้าไปยังเส้นทางชีวภาพเฉพาะ หมู่ไตรฟลูออโรเมทอกซีมีนัยสำคัญในการปรับปรุงความเสถียรและการดูดซึมทางชีวภาพของผลิตภัณฑ์สุดท้าย