2-Chloro-6-fluoroaniline ใช้เป็นสารกลางหลักในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ต่างๆ โดยมีบทบาทสำคัญในการผลิตสารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในการพัฒนาสารกำจัดวัชพืชและสารกำจัดศัตรูพืช สารนี้ยังถูกนำมาใช้ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมในการสร้างส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ที่จำเป็นในการปรุงยา นอกจากนี้ ยังมีการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรมสีย้อม ซึ่งเกี่ยวข้องกับการผลิตสีย้อมและเม็ดสี โครงสร้างทางเคมีที่เป็นเอกลักษณ์ของมันช่วยให้ทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างในปฏิกิริยาเคมีที่ซับซ้อน ทำให้มีคุณค่าในกระบวนการวิจัยและอุตสาหกรรม