2,4,6-Trifluoroaniline ใช้หลักๆ เป็นสารกลางในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการผลิตส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) สำหรับยาที่รักษาโรคการแพทย์ต่างๆ ยังใช้ในการพัฒนาสารเคมีเกษตร ช่วยในการสร้างสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลงที่เสริมการป้องกันพืช ในสาขาวิทยาศาสตร์วัสดุ ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการเตรียมโพลิเมอร์พิเศษและสีย้อม ซึ่งนำไปใช้ในสารเคลือบประสิทธิภาพสูงและการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรม นอกจากนี้ ยังมีบทบาทในการสังเคราะห์อินทรีย์ สนับสนุนการสร้างโมเลกุลซับซ้อนสำหรับการวิจัยและวัตถุประสงค์อุตสาหกรรม เนื่องจากโครงสร้างฟลูออรีนช่วยเพิ่มประสิทธิภาพและความเสถียรของผลิตภัณฑ์ขั้นสุดท้าย