3-Ethynylbenzenamine Hydrochloride ถูกนำมาใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการผลิตเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่ขัดต่อระบบประสาทส่วนกลาง (CNS) กลุ่มเอทินิลของมันช่วยให้สามารถเข้าร่วมในปฏิกิริยาเคมีคลิก (click chemistry) ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโครงสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน นอกจากนี้ ยังใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตรและสารเคมีพิเศษ โดย reactivity ที่ไม่เหมือนใครช่วยในการก่อตัวของสารประกอบใหม่ที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะ รูปแบบ hydrochloride ช่วยเพิ่มความละลาย ทำให้ง่ายต่อการใช้ในปฏิกิริยาที่มีฐานน้ำต่างๆ