2-Fluoro-6-(trifluoromethyl)aniline ใช้หลัก ๆ เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตรหลากหลายชนิด โครงสร้างที่ไม่เหมือนใครซึ่งมีทั้งกลุ่มฟลูออรีนและไตรฟลูออโรมิทิล ทำให้มีคุณค่าต่อการพัฒนาสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพและความเสถียรที่เพิ่มขึ้น ในเภสัชกรรม มักใช้ในการสร้างส่วนประกอบที่ออกฤทธิ์สำหรับยาที่เล็งเป้าไปยังโรคเฉพาะ โดยเฉพาะที่ต้องการโมเลกุลที่มีความเลือกสรรและความแรงสูง ในสารเคมีเกษตร ทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างสำหรับการผลิตสารกำจัดวัชพืช ยาฆ่าแมลง และยาฆ่าเชื้อรา โดยอะตอมฟลูออรีนช่วยเพิ่มประสิทธิภาพและความต้านทานต่อการย่อยสลาย นอกจากนี้ คุณสมบัติของมันยังถูกนำมาใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับการพัฒนาโพลิเมอร์ขั้นสูงและสารเคลือบที่มีลักษณะเฉพาะ