2-Fluoro-3-methoxyaniline เป็นสารตั้งต้นหลักในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตรต่างๆ โครงสร้างของมันที่มีทั้งกลุ่มฟลูออรีนและเมทอกซี่ ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่มีค่าในการสร้างสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะ ในงานวิจัยเภสัชกรรม มักใช้ในการพัฒนายาที่ขัดต่อโรคทางระบบประสาท เนื่องจากอะตอมฟลูออรีนสามารถเพิ่มความสัมพันธ์ในการจับและความเสถียรทางเมแทบอลิซึม นอกจากนี้ ยังใช้ในการผลิตสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง โดยคุณสมบัติทางเคมีของมันช่วยเพิ่มประสิทธิภาพของผลิตภัณฑ์สุดท้าย ความหลากหลายของสารนี้ยังขยายไปถึงการสังเคราะห์อินทรีย์ ที่ซึ่งทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำหรับสีย้อมและสารเคมีละเอียดอื่นๆ