5-Fluoro-3-nitrobenzene-1,2-diamine ใช้หลักในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ที่ซับซ้อน โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านเชื้อราและยาปฏิชีวนะ โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถดัดแปลงทางเคมีเพิ่มเติมได้ ทำให้มีคุณค่าในการสร้างสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะ นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการวิจัยและพัฒนาสีย้อมและเม็ดสี โดยกลุ่มไนโตรและอะมิโนมีส่วนช่วยในคุณสมบัติสีของผลิตภัณฑ์สุดท้าย