4,5-Difluoro-2-methoxyaniline ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในอุตสาหกรรมเคมีและเภสัชกรรม โดยเฉพาะในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมีที่มีความซับซ้อน มักใช้เป็นสารตั้งต้นในการผลิตสารออกฤทธิ์ทางยา (Active Pharmaceutical Ingredients: APIs) และสารประกอบอินทรีย์ที่มีฟลูออรีนเป็นส่วนประกอบ ซึ่งมีความสำคัญในการพัฒนายาใหม่ๆ เช่น ยาต้านมะเร็ง ยาต้านเชื้อจุลชีพ และยาที่เกี่ยวข้องกับระบบประสาท นอกจากนี้ ยังอาจใช้ในการวิจัยทางเคมีเพื่อพัฒนาสารเคมีที่มีคุณสมบัติเฉพาะทาง เช่น สารเรืองแสงหรือสารที่ใช้ในกระบวนการวิเคราะห์ทางเคมี