3-Ethynyl-2-fluoroaniline ถูกใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการพัฒนายา โดยเฉพาะในการสร้างส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) หมู่เอทินิลช่วยให้เกิดปฏิกิริยาเคมีที่หลากหลาย เช่น การจับคู่ Sonogashira ซึ่งช่วยในการสร้างโครงสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน การมีอะตอมฟลูออรีนช่วยเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพและความเสถียรทางเมแทบอลิซึมของสารประกอบที่ได้ ทำให้มีคุณค่าในการค้นพบยาสำหรับโรคเช่นมะเร็ง การอักเสบ และโรคติดเชื้อ นอกจากนี้ ยังใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับการสังเคราะห์โพลิเมอร์ขั้นสูงและสารเคมีพิเศษที่มีคุณสมบัติอิเล็กทรอนิกส์หรือทางแสงที่เป็นเอกลักษณ์