3-Methylbenzenethiol ใช้หลักในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตยา สารเคมีเกษตร และสีย้อม กลุ่ม thiol ของมันทำให้มีคุณค่ากในการสร้างโมเลกุลที่มีกำมะถัน ซึ่งมักจำเป็นในการพัฒนายา นอกจากนี้ ยังใช้ในการเตรียมลิแกนด์สำหรับการเร่งปฏิกิริยาด้วยโลหะ ซึ่งช่วยเพิ่มประสิทธิภาพของปฏิกิริยาเคมีต่างๆ ในอุตสาหกรรมน้ำหอม สารนี้ช่วยในการปรุงสูตรสารประกอบหอมบางชนิด เนื่องจากมีกลิ่นกำมะถันที่เป็นเอกลักษณ์ ความสามารถในการทำปฏิกิริยาของมันยังมีประโยชน์ในเคมีโพลิเมอร์ โดยช่วยปรับโครงสร้างโพลิเมอร์เพื่อให้ได้คุณสมบัติที่ต้องการ