เทสโทสเตอโรน ฟีนิลโพรพิโอเนต ใช้หลักในการบำบัดทดแทนฮอร์โมน (HRT) เพื่อรักษาภาวะที่เกิดจากระดับเทสโทสเตอโรนต่ำในผู้ชาย เช่น ภาวะ hypogonadism โดยช่วยฟื้นฟูระดับเทสโทสเตอโรนให้ปกติ ส่งผลดีต่ออาการเช่น อ่อนเพลีย ภาวะขาดความต้องการทางเพศ และการสูญเสียกล้ามเนื้อ นอกจากนี้ ยังใช้ในการรักษาโรคมะเร็งเต้านมบางประเภทในผู้หญิง ซึ่งช่วยยับยั้งการเจริญเติบโตของเนื้องอก ในด้านกีฬาและบอดี้บิลดิ้ง บางครั้งถูกนำไปใช้ในทางที่ผิดในฐานะสเตียรอยด์อนาโบลิกเพื่อเพิ่มมวลกล้ามเนื้อและสมรรถนะ แม้ว่าจะไม่ใช่การใช้งานที่ได้รับการรับรองทางการแพทย์ คุณสมบัติการปล่อยตัวช้าของสารนี้ทำให้มีประสิทธิภาพในการรักษาระดับฮอร์โมนให้คงที่ในระยะยาว