เกอร์นีลไพโรฟอสเฟต ลิเธียมซอลต์ ใช้หลักในการวิจัยทางชีวเคมีและการศึกษาเอนไซม์ โดยเฉพาะในการสำรวจเส้นทางชีวสังเคราะห์เทอร์พีน ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตเทอร์พีนและเทอร์พีนอยด์หลากชนิด ซึ่งเป็นสารประกอบที่จำเป็นในการพัฒนาน้ำหอม กลิ่นรส และยา ในห้องปฏิบัติการ มักใช้เป็นซับสเตรตสำหรับเอนไซม์ เช่น เทอร์พีนซินเทส เพื่อศึกษากลไกการเร่งปฏิกิริยาและสังเคราะห์สารเทอร์พีนอยด์เฉพาะ นอกจากนี้ บทบาทในการวิเคราะห์เส้นทางเมแทบอลิกทำให้มีคุณค่าในการทำความเข้าใจการชีวสังเคราะห์ผลิตภัณฑ์ธรรมชาติในพืชและจุลินทรีย์