ไฮโดรคลอไรด์ doxycycline ใช้อย่างแพร่หลายในฐานะยาปฏิชีวนะในการรักษาการติดเชื้อแบคทีเรียหลายชนิด มีประสิทธิภาพต่อการติดเชื้อในระบบทางเดินหายใจ เช่น โรคปอดอักเสบและ bronchitis รวมถึงการติดเชื้อในระบบทางเดินปัสสาวะและโรคติดต่อทางเพศสัมพันธ์ เช่น chlamydia นอกจากนี้ ยังสั่งจ่ายสำหรับการติดเชื้อผิวหนัง รวมถึงสิวและ rosacea เนื่องจากคุณสมบัติต้านการอักเสบ ยังใช้ในการรักษาโรค Lyme และมาลาเรียบางประเภท โดยเฉพาะสำหรับนักเดินทางในพื้นที่ที่มีมาลาเรีย ในยาสัตว์แพทย์ ใช้รักษาการติดเชื้อในสัตว์ กิจกรรม broad-spectrum ทำให้เป็นตัวเลือกที่หลากหลายในด้านสุขภาพทั้งมนุษย์และสัตว์