Aztreonam ใช้หลักในการเป็นยาปฏิชีวนะเพื่อรักษาการติดเชื้อที่เกิดจากแบคทีเรียแกรมลบ โดยมีประสิทธิภาพสูงเป็นพิเศษต่อ Pseudomonas aeruginosa ทำให้เป็นตัวเลือกสำคัญสำหรับผู้ป่วยโรค cystic fibrosis ที่มีปัญหาการติดเชื้อทางเดินหายใจ ยาให้ทางสูดดมฉีดเข้าหลอดเลือดดำ หรือฉาดเข้ากล้ามเนื้อ ขึ้นอยู่กับความรุนแรงและชนิดของการติดเชื้อ ในสถานพยาบาล มักใช้รักษาการติดเชื้อทางเดินปัสสาวะที่ซับซ้อน การติดเชื้อในช่องท้อง และการติดเชื้อทางเดินหายใจส่วนล่าง การออกฤทธิ์เฉพาะเจาะจงต่อแบคทีเรียแกรมลบช่วยลดการรบกวนจุลินทรีย์ปกติในลำไส้ ลดความเสี่ยงของการติดเชื้อรอง เช่น Clostridioides difficile Aztreonam ยังเป็นตัวเลือกที่เหมาะสมสำหรับผู้ป่วยที่แพ้ penicillin หรือ cephalosporins เนื่องจากโครงสร้างเคมีที่แตกต่างกัน ซึ่งหลีกเลี่ยงการเกิด cross-reactivity นอกจากนี้ ยังใช้รักษาการติดเชื้อในผู้ป่วยที่มีอาการรุนแรง เช่น การติดเชื้อในกระแสเลือด การติดเชื้อในผู้ป่วยภูมิคุ้มกันบกพร่อง หรือผู้ที่ได้รับการปลูกถ่ายอวัยวะ โดยเฉพาะในกรณีที่แพ้ยาปฏิชีวนะกลุ่มเบต้า-แลคแตมอื่นๆ หรือเชื้อดื้อยา