ซัลฟาดอกซินเป็นยาต้านเชื้อแบคทีเรียในกลุ่มซัลฟาแบบออกฤทธิ์นาน ใช้หลักในการรักษาและป้องกันการติดเชื้อที่เกิดจากแบคทีเรียต่างๆ เช่น การติดเชื้อในระบบทางเดินปัสสาวะ ระบบทางเดินหายใจ และระบบทางเดินอาหาร โดยยับยั้งการเจริญเติบโตของเชื้อแบคทีเรียด้วยการขัดขวางกระบวนการสังเคราะห์กรดโฟลิก ซึ่งจำเป็นต่อการแบ่งตัวของเชื้อ นอกจากนี้ยังใช้ร่วมกับไพริเมทามีนเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพในการรักษาโรคมาลาเรียที่เกิดจาก Plasmodium falciparum โดยเฉพาะในพื้นที่ที่เชื้อดื้อยาต้านมาลาเรียชนิดอื่น ซัลฟาดอกซินยังถูกนำมาใช้ในสัตวแพทย์เพื่อรักษาการติดเชื้อในปศุสัตว์ สนับสนุนสุขภาพและผลผลิตของสัตว์ ครึ่งชีวิตที่ยาวนานช่วยให้สามารถให้ยาในความถี่ที่น้อยลง ทำให้เป็นตัวเลือกที่สะดวกทั้งในมนุษย์และสัตว์ อย่างไรก็ตาม การใช้ต้องได้รับการตรวจสอบอย่างใกล้ชิดเนื่องจากโอกาสเกิดผลข้างเคียงและการพัฒนาความดื้อยา