เอทานอล-d6 ใช้เป็นตัวทำละลายในการวิเคราะห์ทางเคมีและชีวเคมี โดยเฉพาะในเทคนิค NMR (Nuclear Magnetic Resonance) ซึ่งช่วยในการศึกษาโครงสร้างและปฏิกิริยาของโมเลกุล เนื่องจากอะตอมของไฮโดรเจนในเอทานอล-d6 ถูกแทนที่ด้วยดิวเทอเรียม ทำให้ไม่รบกวนสัญญาณในสเปกตรัม NMR จึงเหมาะสำหรับใช้เป็นตัวทำละลายในงานวิจัยที่ต้องการความแม่นยำสูง นอกจากนี้ยังใช้ในงานสังเคราะห์สารเคมีที่ต้องควบคุมสภาพแวดล้อมอย่างเข้มงวด เพื่อหลีกเลี่ยงการรบกวนจากไฮโดรเจนในตัวทำละลาย