ฟลูนิกซินเป็นสารที่ใช้กันอย่างแพร่หลายในสัตวแพทย์เพื่อลดอาการปวดและอักเสบในสัตว์ โดยเฉพาะในสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม เช่น วัว หมู และม้า มักใช้ในการรักษาอาการอักเสบของกล้ามเนื้อและข้อ โรคปอดบวม และอาการปวดหลังการผ่าตัด นอกจากนี้ ยังใช้เพื่อลดไข้ในสัตว์ที่มีอาการติดเชื้อ ฟลูนิกซินช่วยบรรเทาอาการได้อย่างรวดเร็ว ทำให้สัตว์รู้สึกสบายตัวขึ้นและฟื้นตัวได้เร็วขึ้น อย่างไรก็ตาม การใช้ต้องอยู่ภายใต้การควบคุมของสัตวแพทย์เพื่อป้องกันผลข้างเคียงที่อาจเกิดขึ้น