สารสันโทนินถูกใช้เป็นยาถ่ายพยาธิ โดยเฉพาะในการกำจัดพยาธิไส้เดือนในระบบทางเดินอาหาร มีการใช้ในอดีตอย่างแพร่หลายก่อนที่จะมีการพัฒนายาในกลุ่มใหม่ที่มีประสิทธิภาพและมีผลข้างเคียงน้อยกว่า ปัจจุบันจึงมีการใช้น้อยลงเนื่องจากความเป็นพิษและผลข้างเคียง เช่น การระคายเคืองทางเดินอาหาร และอาจทำให้เกิดอาการทางระบบประสาทได้หากใช้ในขนาดสูง นอกจากนี้ ยังมีการศึกษาเกี่ยวกับฤทธิ์ต้านการอักเสบและฤทธิ์ต่อระบบภูมิคุ้มกัน แต่ยังไม่มีการนำมาใช้ในทางคลินิกอย่างกว้างขวาง