ซัลฟาดิเมทอกซินเป็นยาปฏิชีวนะกลุ่มซัลโฟนาไมด์ ใช้หลักในการรักษาในสัตวแพทย์สำหรับการติดเชื้อแบคทีเรียและโปรโตซัวในสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมและสัตว์ปีก รวมถึงการติดเชื้อทางเดินหายใจและลำไส้ในโค กระบือ หมู และสัตว์ปีก รวมถึงโรคค็อกซิเดียซิส (โรคจากโปรโตซัว) ในสัตว์ปีก มีประสิทธิภาพต่อแบคทีเรียแกรมบวกและแกรมลบหลายชนิด และโปรโตซัวบางชนิด นิยมให้ในรูปแบบผสมอาหาร น้ำ หรือฉีด ใช้สำหรับการรักษาและป้องกันในช่วงความเครียดหรือการระบาดของโรค ยังใช้ในการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำเพื่อจัดการโรคติดเชื้อแบคทีเรียในปลา คุณสมบัติออกฤทธิ์ยาวนานเนื่องจากครึ่งชีวิตยาว ช่วยให้ให้ยาน้อยครั้ง เหมาะสำหรับการดำเนินงานฟาร์มขนาดใหญ่