ใช้ในทางการแพทย์เพื่อรักษาการติดเชื้อแบคทีเรีย โดยเฉพาะวัณโรค (tuberculosis) ซึ่งเกิดจากเชื้อ Mycobacterium tuberculosis โดยมักใช้ร่วมกับยาปฏิชีวนะชนิดอื่นเพื่อป้องกันการดื้อยา นอกจากนี้ยังใช้รักษาการติดเชื้อจากแบคทีเรียแกรมลบบางชนิด เช่น Yersinia pestis (เชื้อโรคพากย์) และ Brucella spp. แต่เนื่องจากมีผลข้างเคียงต่อหูและไต จึงมักใช้เฉพาะกรณีที่จำเป็นหรือเมื่อยาอื่นใช้ไม่ได้ผล

นอกจากนี้ยังใช้ในทางการแพทย์สัตว์และการวิจัยในห้องปฏิบัติการเพื่อคัดเลือกเซลล์ที่ถูกดัดแปลงพันธุกรรม

ในภาคเกษตรกรรม ใช้ป้องกันและรักษาโรคพืชที่เกิดจากแบคทีเรีย โดยเฉพาะโรคเน่าหรือโรคใบจุดในพืชผักและผลไม้ เช่น มันฝรั่ง มะเขือเทศ และส้ม แต่การใช้ในพืชต้องควบคุมอย่างเข้มงวดเพื่อลดความเสี่ยงต่อการดื้อยาในมนุษย์