ใช้ในทางการแพทย์เพื่อรักษาการติดเชื้อแบคทีเรีย โดยเฉพาะวัณโรค ซึ่งเกิดจากเชื้อ Mycobacterium tuberculosis มักใช้ร่วมกับยาต้านจุลชีพอื่น ๆ เพื่อป้องกันการดื้อยา นอกจากนี้ยังใช้รักษาโรคติดเชื้อชนิดอื่นที่เกิดจากแบคทีเรียแกรมลบบางชนิด เช่น Yersinia pestis (เชื้อกาฬโรค) และ Brucella spp.

ในภาคการเกษตร ใช้เป็นยาปฏิชีวนะในการควบคุมโรคพืชที่เกิดจากแบคทีเรีย โดยเฉพาะในพืชผักและผลไม้ เช่น โรคเน่าในมันฝรั่ง หรือโรคใบไหม้ในส้ม แต่การใช้ในพืชต้องระมัดระวังเนื่องจากอาจก่อให้เกิดการดื้อยาในมนุษย์ได้

ในห้องปฏิบัติการ ใช้เป็นสารคัดเลือกในการเพาะเลี้ยงเซลล์หรือจุลินทรีย์ที่ถูกดัดแปลงพันธุกรรม โดยเฉพาะในระบบเพาะเลี้ยงเซลล์สัตว์หรือแบคทีเรียที่มียีนต้านทานต่อสเตรปโตมัยซิน