ชิกิมิกแอซิดถูกใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการผลิตยาต้านไวรัสไข้หวัดใหญ่ เช่น โอเซลทามิเวียร์ (Oseltamivir) ซึ่งใช้รักษาและป้องกันการติดเชื้อไวรัสไข้หวัดใหญ่ชนิด A และ B นอกจากนี้ ชิกิมิกแอซิดยังมีบทบาทในกระบวนการสังเคราะห์ทางชีวภาพของกรดอะมิโนกลุ่มอะโรมาติกในพืชและจุลินทรีย์ ทำให้มันเป็นสารสำคัญในเส้นทางการเผาผลาญของสิ่งมีชีวิตบางชนิด ปัจจุบันมีการวิจัยเพิ่มเติมเกี่ยวกับการใช้ชิกิมิกแอซิดในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเป็นตัวบ่งชี้ทางชีวภาพในพืช