สควาลีนถูกใช้เป็นส่วนผสมหลักในผลิตภัณฑ์ดูแลผิวและเครื่องสำอาง เนื่องจากมีคุณสมบัติในการกักเก็บความชุ่มชื้นและซึมเข้าสู่ผิวได้ดี โดยช่วยทำให้ผิวนุ่ม ลดการสูญเสียน้ำจากผิว และป้องกันผิวแห้งลอก นอกจากนี้ยังใช้ในสูตรของครีมกันแดดและผลิตภัณฑ์ต่อต้านริ้วรอย เพราะช่วยเสริมเกราะป้องกันผิวจากมลภาวะและรังสียูวี ในอุตสาหกรรมยา สควาลีนถูกนำมาใช้เป็นสารเติมแต่งในวัคซีน โดยทำหน้าที่เป็นแอ๊ดจูแวนท์ ช่วยกระตุ้นระบบภูมิคุ้มกันให้ตอบสนองได้ดีขึ้น โดยเฉพาะวัคซีนป้องกันโรคไข้หวัดใหญ่และโรคบางชนิดที่ต้องการภูมิคุ้มกันสูง สควาลีนยังมีการนำไปใช้ในผลิตภัณฑ์เสริมอาหาร เนื่องจากเชื่อว่ามีฤทธิ์ต้านอนุมูลอิสระ และช่วยสนับสนุนสุขภาพของเซลล์ผิวหนังและระบบไหลเวียนโลหิต