สารมาตรฐานเฟแนนทรีนใช้เป็นตัวอ้างอิงในการวิเคราะห์ปริมาณสารปนเปื้อนในสิ่งแวดล้อม โดยเฉพาะในงานตรวจสอบน้ำ ดิน และตะกอนที่ปนเปื้อนด้วยสารโพลีไซคลิกอะโรมาติกไฮโดรคาร์บอน (PAHs) ซึ่งเป็นสารพิษที่เกิดจากการเผาไหม้ของเชื้อเพลิงฟอสซิลและวัสดุอินทรีย์ สารนี้จึงมีบทบาทสำคัญในการควบคุมคุณภาพสิ่งแวดล้อมและประเมินความเสี่ยงต่อสุขภาพของมนุษย์และสิ่งมีชีวิตในระบบนิเวศ นอกจากนี้ยังใช้ในการสอบเทียบเครื่องมือวิเคราะห์ เช่น เครื่องโครมาโตกราฟี เพื่อให้ได้ผลการวิเคราะห์ที่แม่นยำและเชื่อถือได้