สารมาตรฐานเฟแนนทรีนใช้เป็นมาตรฐานอ้างอิงในการวิเคราะห์สารปนเปื้อนในตัวอย่างสิ่งแวดล้อม โดยเฉพาะในงานตรวจสอบน้ำ ดิน และตะกอนที่อาจมีสารโพลีไซคลิกอะโรมาติกไฮโดรคาร์บอน (PAHs) ปนเปื้อน โดยสารนี้มักถูกใช้ในห้องปฏิบัติการวิเคราะห์ด้วยเทคนิคโครมาโตกราฟี เช่น GC-MS หรือ HPLC เพื่อควบคุมคุณภาพการวิเคราะห์ ตรวจสอบความแม่นยำของเครื่องมือ และสอบเทียบระบบวิเคราะห์ ช่วยให้การตรวจวัดมีความน่าเชื่อถือและสอดคล้องตามมาตรฐานสากล รวมถึงใช้ในการศึกษาพฤติกรรมของสารเคมีในสิ่งแวดล้อมและการประเมินความเสี่ยงจากมลพิษ