ใช้ในการรักษาการติดเชื้อแบคทีเรียหลายชนิด โดยเฉพาะในระบบทางเดินหายใจ ระบบทางเดินปัสสาวะ และระบบสืบพันธุ์ รวมถึงโรคหลอดลมอักเสบ ปอดบวม ติดเชื้อในกระเพาะปัสสาวะ และโรคหนองใน สามารถใช้รักษาการติดเชื้อในตา เช่น ตาแดงจากแบคทีเรีย หรือติดเชื้อที่ผิวหนังได้ด้วย ออกซาฟลอกซาซินเป็นยาปฏิชีวนะกลุ่มฟลูออโรควิโนโลนที่ออกฤทธิ์ได้กว้าง จึงมักใช้เมื่อเชื้อโรคดื้อยาต่อสารปฏิชีวนะชนิดอื่น